O Concurso para Jovens Cientistas e Investigadores é organizado pela Fundação da Juventude cabendo, porém, a avaliação e a selecção dos trabalhos a um Júri designado pela Ciência Viva - Agência Nacional para Cultura Científica e Tecnológica, Júri esse que integrará professores e investigadores de reconhecido mérito das diferentes áreas científicas envolvidas.

O Júri integrará, ainda, representantes da Fundação da Juventude, da Ciência Viva, da Direcção Geral de Inovação e de Desenvolvimento Curricular, da Agência Portuguesa do Ambiente e da TMN.

Os prémios principais a atribuir aos alunos e projectos seleccionados, financiados pela Fundação para a Ciência e a Tecnologia, são:
1º Prémio – €2.000 (dois mil euros)
2º Prémio – €1.500 (mil e quinhentos euros)
3º Prémio – €1.000 (mil euros)
4º Prémio – €500 (quinhentos euros)
Um Prémio Especial Ambiente – €1.000 (mil euros), financiado pela Agência Portuguesa do Ambiente.
Um Prémio Especial TIC – em espécie (telemóveis e computador portátil), financiado pela TMN.
Um Prémio Especial Professor(a) Coordenador(a) do 1º Prémio - €500 (quinhentos euros).

Podem também ser atribuídas Menções Honrosas, não pecuniárias, aos trabalhos que manifestamente apresentem índices de inovação e oportunidade relevantes, sob decisão unânime do Júri, para além do Júri poder atribuir prémios ex-aequo, relativamente aos 4 prémios principais.
O Prémio Especial Professor(a) Coordenador(a) do projecto vencedor do 1º Prémio, destina-se a gratificar o empenho e a dedicação no acompanhamento do trabalho, valorizando assim a experimentação e a investigação aplicada em processos educativos regulares.
Na edição de 2010/2011 serão, ainda, atribuídas Diciopédias 2010 aos premiados, editadas e oferecidas pela Porto Editora.