Para facilitar a organização dos trabalhos, sugere-se que sejam considerados os seguintes pontos:

• Título (deve ser curto e preciso),
• Índice,
• Sumário,
• Introdução,
• Experiência (Metodologia),
• Discussão (Comparação dos resultados com a teoria),
• Conclusão (Breve sumário dos Resultados) e
• Bibliografia utilizada.

A avaliação do Júri ocorre em dois momentos distintos, sendo o primeiro a avaliação documental de todos os trabalhos submetidos a concurso, avaliando-se a estrutura e a apresentação do trabalho, o conteúdo científico e o nível de experimentação, seleccionado então os 100 trabalhos que irão participar na Mostra Nacional de Ciência.

O segundo momento decorre durante a Mostra de Ciência, através de entrevista, durante a qual o Júri avalia a apresentação do projecto no stand, a clareza no discurso, o rigor científico, a originalidade e a criatividade.

Os Prémios são atribuídos por unanimidade na reunião final do Júri, depois de decorrido todo o processo de análise documental e as entrevistas, não havendo recurso dessa decisão.